与以硅谷为代表的发达国家科技园相比较，中国高新区不论规模还是效益，不论转化科技成果还是园区管理建设上，都有很大的差距。
科技部有关人士坦言，高新区发展最严重的阻碍首先还是观念；同时，中国的“风险投资”至今仍千呼万唤出不来，也是一大阻碍；与风险投资有关的科技中小型企业股票上市问题，似乎也到了该解决的时候了；立法的滞后，也是中国高新区面临的一个很大问题。
除此之外，有人指出，政府采购使硅谷获得了一次飞跃的动力，而我国的政府采购才刚刚开始。但另一些人认为，这些都是可以学来的。真正无法学习、甚至无法比较的差距在于，我们缺少硅谷那种创业者文化。那是一种由成千上万创业者的热情、愿望、目标、氛围融合成的文化。它推动着创业者自发地结成一个创业者网络——在法律保护下没有界限的自由交流，优势互补，不断碰撞出新的思想，诱发出新的灵感，产生新的发明。我国的高新区虽然也聚集了成千上万的创业者，可彼此疏离，少有交流。
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